DYNAMO是Fortran 90模块库,使用分子动力学(MM)和混合量子力学(QM)/MM势能函数,用于模拟分子体系。 AM1,MNDO和PM3半经验QM哈密顿量 OPLS-AA MM力场 能量计算 几何优化 寻找过渡态 反应路径计算 简正模式分析 特性计算(电荷和偶极矩) 分子动力学计算 Langevin动力学计算 蒙特卡罗(Monte Carlo)计算 各种“软”几何结构限制 各种分析工具